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利用入线的可变光程紫外光谱和偏最小二乘回归法对制备色谱进行蛋白质选择性定量分析

发布日期:2024-07-22 13:32:04   浏览量 :156
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原文要点

  • 制备色谱的各个步骤使用PAT监测;

  • 可变光程的紫外/可见光谱用于入线测量,测量的蛋白质浓度达75 g/L;

  • 通过偏最小二乘回归法(PLS)进行蛋白质的选择性定量;

  • 通过PLS模型的计算来控制纯化步骤。

  • 摘要

    在蛋白质制备色谱中,蛋白质浓度的宽动态范围,以及产品和杂质的共洗脱现象是很常见的。尽管制备色谱是生物制药生产的标准,但对其监测通常使用的是替代信号,如280nm处的紫外吸收。为了解决这个问题,可变光程(VP)光谱与偏最小二乘回归法(PLS)相结合,被用来监测制备色谱。本研究中,该方法先是用于监测溶菌酶(Lys)与细胞色素c(Cyt c)在92 g/L的总装填密度下的分离。然后,同样的方法被应用于单克隆抗体(mAb)在40 g/L装填密度下的抛光步骤。对于mAb单体和高分子量变体(HMWs)的PLS模型预测,均方根误差(RMSE)分别为1.07 g/L和0.42 g/L。总之,VP光谱与PLS建模相结合,是未来大规模入线监测和控制色谱步骤的一个有前途的选择。


    介绍

    在当前的生物制药纯化过程中,制备液相色谱法是从含培养基成分、DNA、宿主细胞蛋白质和产品相关杂质中分离出目标产品的关键。使用这种方法是因为它的高分离能力,同时还可更大限度地减少产品损失。

    制备色谱过程通常在高装填密度下运行,以实现高效过程。高的装填密度随后会导致从柱上洗脱的蛋白质馏份的浓度范围很广。因此,监测技术必须具有很宽的动态范围,以捕获峰值浓度以及峰侧较低浓度的杂质。此外,由于制备色谱的分辨率有限,产品和杂质之间的基线分离很难实现。因此,PAT技术应选择性地量化产品和主要杂质。由于色谱法的快速变化,色谱法过程中的决策时间是很有限的。

    目前有许多不同的文献方法被用于了色谱的实时监测。制备色谱的在线监测和控制,已通过高效液相色谱自动取样和后续分析实现。制备液相色谱中的宽浓度范围可以通过改变进样量来轻松控制。但缺点是,由于样品处理和分析时间以及污染风险的影响,会造成时间的延迟。

    此前,紫外/可见光谱已被提议作为色谱过程入线监测的方法。它对模型蛋白质的多组分混合物和实际分离问题都很有用。为了增加光谱采集的动态范围,设计出了新的测量池,它允许连续改变光程的长度,以实现几乎任何分析物的浓度,并具有理想的灵敏度。这种方法与PLS建模相结合,成功地用于监测废水的化学需氧量。该方法由一家商业供应商进一步开发,用于了蛋白质的相关应用,可以在广泛的浓度范围内测量蛋白质光谱,测得的蛋白浓度可达250 g/L。最近,有供应商又推出了一条用于入线可变光程(VP)测量的产品线。该设备能够提供高达约80 AU/mm吸光度的测量结果,对应于近600 g/L的mAb浓度。

    本研究展示了通过UV/Vis 可变光程光谱结合PLS建模对制备色谱进行入线监测。VP光谱可以在几乎任意的蛋白质浓度下监测色谱过程,且PLS模型可以从光谱数据中选择性地量化多个共洗脱组分。本研究中,该方法先是用于在高装填密度下分离模型蛋白:溶菌酶(Lys)和细胞色素c(Cyt c)的混合物。前者是产品,后者是污染物。

    随后,使用该方法监测了mAb单体及其HMWs的制备抛光步骤。为了证明这种方法在过程控制方面的有效性,根据模型系统的洗脱蛋白的预测浓度或单抗的计算纯度,对这两个分离案例中的产品池进行了入线控制。


    材料和方法

    色谱仪器

    制备色谱实验均是在配有样品泵S9的ÄKTA Pure 25系统上进行。另外,使用FlowVPE可变光程的紫外/可见分光光度计(C Technologies, Bridgewater, USA)监测色谱柱的流出物,它被整合到AKTA系统的电导率监测器和分数集电器之间的流程中。使用Dionex UltiMate 3000快速分离液相色谱系统对收集到的馏分进行分析。

    可变光程色谱

    FlowVPE可变光程光谱仪使用一根可移动的光纤来改变流通池的光程L(图1)。一个可变光程的测量周期包括一个筛选阶段和一个随后的采集阶段。在筛选阶段,根据在280 nm处的5、25、100 μm三个光程的3次测量值,仪器会计算出采集阶段的更佳光程。

    图1可变光程光谱法:每个测量周期,通过驱动FlowVPE的光纤来实现可变的光程L。在确定更佳测量光程的筛选阶段结束后,仪器会测出5个不同光程的紫外吸光度。接着计算每个波长的斜率,给出一个斜率值。然后产生一个三维的(时间,波长,斜率)的色谱图。


    在采集阶段,仪器于五个不同的光程位置上测得对应的吸光度Aw,i(i取值在{1,2,3,4,5};w为选定的波长)。基于郎勃-比尔定律,假设吸光度估计值Ãw与光程L之间存在线性相关(公式(1))。那么,通过公式(2)中的最小二乘问题,可以估计出斜率mw和截距bw。

    由于斜率是在整个色谱运行过程中得出的,而且实验结果是由时间、波长、斜率确定的,因此它是一个三维的色谱图。通过等式(1)和郎勃-比尔定律,可以导出以下等式(3)。

    这表明,斜率与蛋白质浓度C、消光系数ew相关。由于只考虑斜率,因此光纤的偏移对最终结果没有影响。一般来说,对于中紫外光谱的测量时间大约需要30秒。

    实验案例

    文章研究了Cyt c与Lys的分离、从mAb单体中分离HMWs两个案例,实验详细步骤见原文。


    结果与讨论

    如实验所述,在两个案例研究中都进行了不同光程下的线性梯度测量,以得到不同的混合比和被检测蛋白质的浓度。

    可变光程光谱法在色谱分析中的应用

    在可变光程光谱法中,仪器在不同的光程下测量吸光度。图2A为280 nm处的典型色谱图。绿线表示不同光程下随时间变化的吸光度。相应的光程用灰色线表示。用橙色表示随时间变化的斜率。如图等式(3)所示,斜率与总蛋白浓度呈线性关系。值得注意的是,在蛋白质洗脱过程中,吸光度值几乎保持不变,而光程则减少。在筛选阶段,选择测量阶段的更长光程,使其在280 nm处的吸光度约为1 Au。因此,设置的光程与斜率是成反比的,从而它也与蛋白质浓度成反比(图2A)。

    图2  用VP波谱得到的单波长(A)和多波长(B)的典型色谱图 A: 绿线表示在不同光程处获得的吸光度值(灰线)。在每个时间点,斜率(橙色线)由5个吸光度值和光程之间的线性确定。B: 如果在色谱运行过程中记录斜率,则得到三维色谱图。


    图2A显示了一个波长的典型色谱图,而图2B显示了多个波长的色谱图。它们不是单波长的斜率,而是斜率光谱。由于斜率是在整个色谱运行过程中产生的,这导致得出了在(时间、波长、斜率)处的三维色谱图。所得到的三维色谱图是PLS模型校准和确认的起点。

    案例1:Cyt c与Lys的分离

    由于芳香族氨基酸的质量分数以及Cyt c中血红素基团的不同,Cyt c和Lys的紫外光谱存在显著差异(图3A)。

    在交叉验证的基础上,选择2、3个潜在变量的Lys和Cyt c。三次校准运行(梯度长度为2、4和8 CVs)的PLS模型预测结果如图4A、B和D所示。这些图将Lys(蓝色实线)和Cyt c(红色实线)的PLS模型预测与相应的参照结果(蓝色条为Lys,Cyt c)进行了比较。在所有校准运行的PLS模型预测和参考模型之间都有很好的一致性。

    图3  案例研究I(A)和案例研究II(B)的蛋白质斜率的比较。

    图4  将lys和cyt c的PLS模型预测与(A)2 CV、(B)4 CV、(C)6 CV和(D)8 CV梯度长度的离线参照结果进行比较。PLS模型预测的蓝色和红色阴影说明了平滑的效果。


    为了确认该模型,我们对6 CV梯度运行进行了预测,并密切遵循相应的参照(图4C)。图4中PLS模型预测的不同蓝色和红色阴影说明了非平滑和平滑数据(非平滑数据颜色较浅,平滑数据颜色较深)。Cyt c的RMSE为0.53 g/L,Lys为1.11 g/L。使用Savitzky-Golay滤波器的平滑预测数据,Cyt c 的RMSE为0.48 g/L,Lys为1.05 g/L。应用Savitzky-Golay滤波器明显改善了预测Lys和Cyt c的RMSE(表1)。

    VP光谱和PLS模型的结合允许在色谱柱中选择性定量Lys和Cyt c,峰浓度高达80 g/L。说明该方法适用于制备色谱的典型浓度范围。

    案例2:从mAb单体中分离HMWs

    与Cyt c和Lys相比,mAb单体和HMWs可能含有相同质量分数的芳香族氨基酸和二硫键桥。因此,光谱的差异要么与三级结构的变化有关,要么与光散射有关。因此,mAb单体和HMWs的光谱差异相对较小(图3B)。这使得通过PLS建模的量化更具挑战性。

    在交叉验证的基础上,mAb单体采用4个潜在变量的PLS1模型,HMWs采用8个潜在变量的PLS1模型。图5A、C、D显示了三次校准运行(梯度长度为4、6、7 CVs)的PLS模型预测,而图5B显示了确认运行的结果(5 CV梯度)。图中显示了mAb单体的PLS模型预测(实蓝线)和HMWs(实红线)与参照结果(蓝条为mAb单体,红条为HMWs)的比较。在所有四次运行中,模型预测与参照非常匹配。结果表明,该方法对蛋白质的适用性,在吸收光谱上只有轻微的差异。mAb单体的预测RMSE为1.26 g/L,HMWs的预测RMSE为0.50 g/L。通过使用Savitzky-Golay滤波器平滑数据,可以进一步降低RMSE。这使得mAb单体的RMSE值为1.07 g/L,HMWs的RMSE值为0.42 g/L。图4比较了所有运行的非平滑数据和平滑数据。应用Savitzky-Golay滤波器改善了预测mAb单体和HMWs的RMSE(表1)。

    入线池化决策

    为了显示VP光谱学与PLS建模的有效性,把所实施的方法用于了过程决策。在这两个案例研究中,对色谱运行都进行了带有过程干扰的池化决策。

    收集到的池通过离线检测进行分析,都可以做出准确的预测,但会有微小的偏差。对于Cyt c和Lys的分离,预测其纯度为99.0%,而离线分析测定的纯度为99.7%。对于mAb单体产品池,PLS模型预测的纯度为94.4%,而通过离线分析测量的纯度为94.2%。在这里,Savitzky-Golay滤波并没有使预测得到改进,这是因为测量噪声会随着时间的推移而自我抵消(表2)。

    图5  将mAb单体和HMWs的PLS模型预测与(A)4 CV、(B)5 CV、(C)6 CV和(D)7 CV梯度长度的离线参照结果进行比较。PLS模型预测的蓝色和红色阴影说明了平滑的效果。

    表1  RMSE表示两个案例研究的确认运行中的预测:将未过滤预测的RMSE与过滤数据的RMSE进行比较。

     

    图6  在案例研究I(A)和案例研究II(B)的入线对照运行中,PLS模型预测的蓝色和红色阴影说明了平滑的效果。根据非平滑的数据,计算出池的纯度(黑色)。这些细的黑色竖线表示池化的开始和结束。

    表2  对于这两个案例研究,基于PLS模型预测纯度,并与离线分析的相应结果进行比较。

    以上结果表明,该方法可用于色谱系统的入线控制。使用的保留时间为10min,高于工业标准。在洗脱过程中降低流速是合理的,因为洗脱阶段相对于整个过程相对较短。另外值得注意的是,这里所讨论的方法要比文献中提出的在线HPLC PAT方法要快得多,因为在生产规模中,在线HPLC的响应时间减慢了约2.5倍到3倍。

    结论与展望

    本研究成功地实现了制备色谱法的入线监测。研究表明,可变光程的紫外/可见光谱和PLS模型的结合,允许在很宽的浓度范围内入线进行蛋白质的选择性定量。该方法还可以监测高装载色谱柱的运行,产品峰值浓度在30 g/L至80 g/L之间变化,而污染物峰值浓度为4 g/L至20 g/L。总之,该方法具有对制备色谱法的入线监测和控制的潜力,它也可以适用于连续色谱法中对时间切换的控制。

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